미국 대통령 직속의 에이전트인 레온은 기밀 정보를 쥐고 있는 안토니오 테일러를 납치한 무장 집단의 차량을 쫓고 있었다. 하지만 갑자기 나타난 수수께끼의 여자의 방해를 당해 범인들을 놓치게 된다.

한편, 대바이오테러 조직 'B.S.A.A.'의 크리스는 샌프란시스코를 중심으로 일어나고 있는 감염 경로[9]불명의 좀비 발생 사건을 담당하고 있었다.

조사 결과, 바이러스의 피해자 전원이 있는 장소를 방문하고 있었던 것을 밝힌다.

거기는 한때 감옥으로 사용되었던 감옥도 알카트라즈다.

섬에 조사를 향하기 위해, 크리스 일행은 페리에 탑승한다.